定量PCR（Polymerase Chain Reaction）技術有廣義概念和狹義概念。廣義概念的定量PCR技術是指以外參或內(nèi)參為標準，通過對PCR終產(chǎn)物的分析或PCR過程的監(jiān)測，進行PCR起始模板量的定量。狹義概念的定量PCR技術（嚴格意義的定量PCR技術）是指用外標法（熒光雜交探針保證特異性）通過監(jiān)測PCR過程（監(jiān)測擴增效率）達到定量起始模板數(shù)的目的，同時以內(nèi)對照有效排除假陰性結(jié)果（擴增效率為零）。
PCR過程的監(jiān)測有多種檢測模式。zui常用的有三種檢測模式：
⑴SYBR Green I 檢測模式。溫度循環(huán)為94—55—72°C三步法，只有引物，無探針，熒光染料鑲嵌在雙股螺旋鏈中間。通過對特定方向的強熒光檢測獲得信號，這種試劑檢測模式易產(chǎn)生非特異信號，且本底光較大。
⑵水解探針模式（Taqman）Hydrolysis Probe。溫度循環(huán)為94—60°C二步法，不僅有引物，還有另外一個特異針對擴增模板的探針在引物對之間。在探針相鄰兩個堿基上分別結(jié)合兩個熒光染料，一個染料接受激發(fā)光得到的能量傳給了第二個染料，接受能量的第二個染料通過發(fā)射特征光子回到穩(wěn)定態(tài)。當Taq酶在60°C延伸擴增鏈時，遇到探針，利用Taq酶5`—3`外切酶活性將探針水解成單個堿基，單個堿基之間距離較遠，*個染料的能量無法傳給第二個染料，只好通過發(fā)射特征光子回到穩(wěn)定態(tài)，通過對溶液中*個染料的熒光檢測獲得信號。這種試劑檢測模式增加了檢測信號的特異性，但是由于利用了Taq酶5`—3`外切酶活性，一般試劑廠家只給Taq酶的聚合酶活性定標，沒有同時給Taq酶5`—3`外切酶活性定標，不同批號試劑之間會給定量帶來差異。另外對探針的熔點溫度（Tm）僅要求其高于60°C，這就使不同試劑盒之間的特異性參差不齊，而且無法做質(zhì)控檢測。
⑶雜交探針（Hybridization Probes）模式。溫度循環(huán)為94—55—72°C三步法，有引物，二個特異針對擴增模板相鄰的探針在引物對之間，在一個探針3`堿基上結(jié)合一個熒光染料，在另一個探針5`堿基上結(jié)合第二個熒光染料。在55°C時，兩個探針都剛好接合在模板上，*個染料接受激發(fā)光得到的能量傳給了第二個染料，接受能量的第二個染料通過發(fā)射特征光子回到穩(wěn)定態(tài)，通過對結(jié)合在擴增模板上雙探針中第二個染料的熒光檢測獲得信號。這種試劑檢測模式中熒光信號與特定雜交溫度相關，探針的濃度始終保持不變，因此可以在擴增后檢測熔解曲線作為信號的特異性質(zhì)控。另外這種試劑檢測模式可以用于點突變檢測。
